1、北京大学，首批博士点45个，在所高校中，排名第一
2、清华大学，首批博士点34个，在所高校中，排名第二
3、南京大学，首批博士点24个，在所高校中，排名第三
4、复旦大学，首批博士点23个，在所高校中，排名第四
5、 上海第一医学院、上海医科大学，后并入复旦大学，首批合计博士点21个，在所高校中，排名第五
6、北京师范大学，首批博士点17个，在所高校中，排名第六
7、中国协和医科大学，后并入清华大学医学部，有15个博士点
8、 浙江大学，有14个博士点，排名全国第八
9、西安交通大学、北京医学院(后并入北大医学部），各有13个博士点，并列排名全国第九
10、上海交通大学、南开大学、华东师范大学，各有12个博士点，并列排名全国第十一
11、中国科学技术大学、北京航空管理学院（后改为北航）、武汉大学，各有11个博士点，并列排名全国第十四
12、中山大学、吉林大学，各有10个博士点，并列排名全国第十七
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